男人腰疼小肚子疼可能是强直性脊柱炎或是尿道结石等引起的，具体如下：

1、强直性脊柱炎。强直性脊柱炎是一种血清阴性脊柱关节病，属于多基因遗传病，主要累及到腰骶部、髋关节、颈部等，各种外周关节都可以累及。患者主要表现为腰背痛、膝关节痛、踝关节痛等。强直性脊柱炎的治疗主要是综合性的治疗，包括药物治疗和非药物治疗。非药物治疗是需要患者做一些功能锻炼，注意坐姿、站姿和睡姿，睡硬板床等。药物治疗主要是用止疼药缓解患者的疼痛，常用的药物是非甾体类抗炎药，如对乙酰氨酚、阿司匹林等。如果该类药物疗效差，还可以用生物制剂治疗。患者在生活中应该避免强力负重，避免长时间维持一个姿势不动，睡眠时避免垫枕头且不睡软床；清晨起床背脊僵硬时，可以热水浴来改善。

2、尿道结石。尿道是指从膀胱出口，到生殖器前端的排尿管道，位于尿道的结石称为尿道结石。其主要表现为排尿困难、腰痛腹痛等。如果患者体内的结石小于1CM，同时表面很光滑，没有明显不适的感觉，也没有发生感染或是排尿困难的情况，是可以选择非手术的保守治疗方法处理的，这时需要患者增加食量，从而增加排尿量，稀释沉淀的结晶，最终让结石随着尿液排出体外。如果患者体内结石比较大，且患者腰部有明显的疼痛感，或是已经并发了感染，就要通过手术的方法取出结石。