小脚趾甲变厚发黄凸起可能是灰指甲引起的，也可能是厚甲症导致的，建议患者及时就医，明确病因后对症治疗，具体如下：

1、灰指甲：由于局部真菌感染可能会引起小脚趾甲变厚和出现发黄凸起的症状，灰指甲病程相对较长，且具有传染性，若不进行系统性治疗无法自愈，还可能会导致脚趾甲出现浑浊、分离、萎缩、脱落等症状。患者可以去医院通过真菌涂片镜检，以及培养真菌明确诊断。确诊灰指甲后，医生通常会根据病情、不同致病菌选择合适的治疗方案。一般可遵医嘱使用特比萘芬、伊曲康唑进行口服抗真菌治疗，也可以选择盐酸特比萘芬乳膏、硝酸舍他康唑软膏等药物外涂治疗。必要时需遵医嘱进行病甲清除术或病甲拔除术。

2、厚甲症：由于先天性原因或者后天性感染可能会引起小脚趾甲明显变厚，导致小脚趾甲变黄凸起，且比较坚硬，严重影响到小脚趾甲的美观，对患者的指甲健康和日常生活也可能会产生不良的影响。可以选择尿素软膏、复方乳酸乳膏水杨酸软膏等药物来治疗。主要的目的是软化局部的皮肤、软化角质层、改善不舒服的症状。也可以通过局部的手术拔出指甲进行治疗。但是疾病有可能还会反复发作，一般并不能够达到完全根治的目的，需要定期的进行复查。

此外，平时还应该注重个人的饮食习惯，多补充维生素、微量元素等物质。同时要避免接触到刺激性的化学产品，保持皮肤的整洁，以免加重病情。