人流后发现衣原体感染，需要在医生指导下使用抗生素来进行治疗。可以做药敏试验，选择敏感的药物进行治疗，治疗期间不能够发生性生活，人工流产后要注意休息，避免劳累，4周以内禁止性生活，以免发生逆行感染，可以在医生指导下服用罗红霉素或者是红霉素类的药物治疗。