小儿抽动的发病原因尚不明确，目前推测主要有以下几点原因：

社会心理因素：由于儿童心理发育不成熟，如果在此期间家庭关系不和谐，经常打骂或在学校受到不当的体罚和歧视，会对儿童造成重大精神创伤，导致抽动或多动症等异常行为;对孩子过于苛刻粗暴，会造成长期过度的心理紧张、情绪压抑和行为障碍;父母对孩子要求过高，早期智力发展过度，使外界环境的压力远远超过儿童的承受能力，也是儿童抽动症的原因之一。

遗传因素：短暂性抽动障碍可能具有家庭聚集性，抽动障碍在儿童家庭成员中更为常见。分子遗传学研究表明，抽动障碍与多巴胺-D4受体有一定的相关性，额叶和基底神经节在调节运动活动中起着重要作用，大脑这些区域的功能障碍可以降低其抑制功能，从而导致儿童抽动障碍，因此认为儿童抽动障碍的病因可能与遗传因素有关。

体质因素：某些神经精神类型的儿童容易患这种疾病，如神经质、胆怯、多动、情绪不稳定、对人和事敏感、固执，而且这种疾病往往伴有不明原因的头痛、腹痛、便秘、遗尿等，因此推测儿童抽动症与儿童自身的体质因素有关。

精神因素：一些精神刺激可以诱发这种疾病，如过度的学习要求、过度的责备、家庭不和谐、情绪被忽视或环境中的一些紧张气氛等，这些因素都会导致孩子产生矛盾心理，抽动行为是心理矛盾的外在表现，此外过度限制儿童的活动也会成为这种疾病的诱因。