抽动障碍的病因复杂，至今在医学界尚无定论，目前倾向于不是单一原因，而是多种原因造成的，可能是遗传因素和非遗传因素(生物因素、心理因素和环境因素)在发育过程中相互作用的结果。根据研究，一般认为有以下因素的儿童容易患抽动障碍:

1.遗传因素：如果家庭中有抽动障碍患者，患这种疾病的几率明显高于家庭没有抽动障碍的，因此认为与家庭遗传有关，遗传方式倾向于常染色体显性遗传不完全显现。

2.围产期损伤：孕妇孕期有高烧、难产、产期窒息、新生儿高胆红素血症、剖腹产等病史，母亲怀孕期间吸烟会增加抽动障碍的严重程度，并使合并强迫症的风险比普通人高8倍。

3.感染因素：呼吸道感染、扁桃体炎、腮腺炎、鼻炎、咽炎、水痘、各种脑炎、肝炎等，特别是链球菌感染可能导致严重抽动的突然发病，因此该病也被称为与链球菌感染相关的儿童自身免疫神经精神障碍(英文缩写为PANDAS)。

4.精神因素：惊吓、情绪激动、悲伤、儿童学习负担过重、长期焦虑、看惊险电视、小说和刺激的动画片、惊吓等。

5.家庭因素：父母关系紧张，离异，训斥或打骂孩子，父母对孩子管教严格，家庭环境不好等。

6.药源因素：儿童长期服用抗精神病药物或中枢兴奋剂。

7.脑损伤：癫痫、脑损伤或各种原因引起的轻微脑功能障碍。

8.饮食因素：长期食用含有食品添加剂或防腐剂的食品。

9.易患年龄和性别：大多数抽动障碍发生在2-15岁，学龄前和学龄儿童是发病高峰人群，90%在10岁之前发病，最常见于5-9岁，男性明显多于女性，至少三倍。