一般情况下，3-6岁儿童扁桃体肥大可能是儿童免疫需求、遗传因素、生理性免疫反应、急性扁桃体炎、慢性扁桃体炎、扁桃体占位性病变导致的。

1、儿童免疫需求：

3-6岁儿童正处于免疫系统发育的关键时期，扁桃体作为重要的免疫器官，会出现生理性增大以满足免疫需求。此时，儿童可能并无明显症状，或仅有轻微的咽部不适。此时需要密切观察，若无其他症状，通常无需特殊处理，随着年龄增长，扁桃体一般会逐渐萎缩。

2、遗传因素：

部分儿童扁桃体肥大可能与遗传有关。若家族中有扁桃体肥大的病史，儿童出现扁桃体肥大的可能性较大。此时，儿童可能同样无明显症状，或症状较轻。处理方法与上述相同，即密切观察，无需特殊处理。

3、生理性免疫反应：

当儿童接触外界病毒、细菌等病原体时，扁桃体作为免疫防线会出现反应性增大。此时，儿童可能出现咽部疼痛、发热等症状。此时需要增强免疫力，如保证营养均衡、适量运动等，同时密切观察病情变化，必要时在医生指导下进行药物治疗。

4、急性扁桃体炎：

可由病毒或细菌感染引起，导致扁桃体充血、肿大。可导致咽部疼痛、吞咽困难、发热、咳嗽等症状。患者可以在医生的指导下使用阿莫西林、头孢克洛颗粒或阿奇霉素进行治疗。

5、慢性扁桃体炎：

多由急性扁桃体炎反复发作或治疗不彻底转变而来，导致扁桃体长期肿大。可导致咽部异物感、咽干、咽痒、咳嗽等症状。患者可以在医生的指导下使用青霉素V钾片、蒲地蓝消炎口服液或蓝芩口服液进行治疗。

6、扁桃体占位性病变：

如扁桃体息肉、扁桃体乳头状瘤等，也可导致扁桃体肥大。可导致咽部不适、异物感、吞咽困难等症状。对于这类疾病，通常需要在医生指导下进行手术治疗。患者可以在医生的指导下使用（针对术后恢复或预防感染的药物，如头孢呋辛酯、甲硝唑或康复新液）进行治疗，但具体药物需根据手术情况和医生建议确定。

但是需要注意的是，家长应密切关注孩子的病情变化，及时就医并遵医嘱进行治疗。同时，保持良好的生活习惯和饮食习惯，增强免疫力，对预防扁桃体肥大也有重要作用。