肛肠镜检查是存在一定程度的危险性的。肛肠镜在检查之前和检查过程都可能会发生危险。做肛肠镜检查之前需要排泄，需要喝一些泻药，还要多喝水，如果有部分水没有被排出去，或者没被排出去之前就被大量吸收了，病人的血容量或血液中的水分会大大增加，这会导致水中毒这种非常危险的情况发生，而水中毒也可能引发脑水肿。肛肠镜在通过肠道的一些弯道时，会对肠道造成牵拉，如果肠道的弯度特别大，操作者的力气又很大，如果肠道局部发生溃疡，或者糜烂，如果医生暴力操作，可能会导致穿孔。如果在肠道里面发现病变，就需要做病理活检，有些病变下面的血管非常丰富，或病变本身的局部凝血功能不好，取完病理标本后非常容易血流不止，这也是危险之一。